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實驗技術(shù) | PCR實用tips 請查收!
來源: | 作者:百菱生物 | 發(fā)布時間: 764天前 | 2039 次瀏覽 | 分享到:

此文章轉(zhuǎn)載自:無錫耐思NEST





PCR(Polymerase Chain Reaction)是1983年由Kary Mullis發(fā)明,至今仍廣泛使用的DNA擴增技術(shù)。它通過高溫解鏈、低溫退火、中溫擴增的過程,來實現(xiàn)目標(biāo)片段DNA的指數(shù)級擴增。


PCR反應(yīng)體系可以簡單概括為三部分:DNA模板(Template)、引物(Primer)及DNA聚合酶預(yù)混液(PreMix,MasterMix等),其中商業(yè)化的DNA聚合酶產(chǎn)品預(yù)混液已包括濃度優(yōu)化過的DNA聚合酶、三磷酸核苷(NTPs)、Mg2+、緩沖液及惰性染料等,可以根據(jù)實驗需要選擇擴增速度、保真性不同的DNA聚合酶以及預(yù)混染料的產(chǎn)品。整個體系經(jīng)常為20μL或50μL的體積,可置于0.1mL或0.2mL的PCR管中。


PCR熱循環(huán)儀是實現(xiàn)PCR反應(yīng)的外部硬件,按照設(shè)定的反應(yīng)程序,利用金屬浴來按時加熱、冷卻PCR反應(yīng)體系來完成解鏈、退火和擴增的過程。溫度和時間的設(shè)定受引物Tm(DNA Melting Temperature,熔解溫度)、目標(biāo)序列長度及DNA聚合酶擴增速度影響。一個典型的PCR程序如下:

PCR體系組分的Tips:



1. DNA模板
a)起始模板含量依據(jù)DNA類型及DNA聚合酶性質(zhì)來決定。一般質(zhì)粒DNA模板起始含量為0.1~1ng,基因組DNA以5-50ng為佳,例如25ng/μL的基因組DNA模板,加1μL左右就夠了。過少的模板會降低得率,過多則會導(dǎo)致非特異性擴增。
b)模板提取過程中,模板完整性受到損壞或提取試劑殘留都可能會導(dǎo)致PCR反應(yīng)失敗。PCR反應(yīng)出現(xiàn)不擴增或異常時,可以考慮用電泳檢驗DNA完整性以及使用Nanodrop測定DNA純度來排除問題。
2. 引物
a)引物設(shè)計對長度、堿基構(gòu)成、序列有很多限制,但目前很多軟件都可以輔助引物設(shè)計來規(guī)避可能出現(xiàn)的問題。擴增引物和用于引入點突變的引物都可以借助軟件來設(shè)計。
b)引物終濃度需要控制在適配DNA聚合酶的范圍內(nèi),實際使用時可以將上下游引物預(yù)混直接加入,減少時間及槍頭成本哦。
3. 
一定要用不含DNA酶(DNase-free)的水,也可以預(yù)混到引物里面,算好濃度和體積就行,體系不足的體積都由水來補足。

4. DNA聚合酶預(yù)混液

a)最后加入體系以保證對存貨(stock)的最小污染,加完后可用槍頭緩慢混勻。

b)直接上電泳的基因分型實驗可以選擇預(yù)混Loading buffer的DNA聚合酶,省去了很多加樣的時間。


PCR結(jié)束后應(yīng)盡量當(dāng)天進行后續(xù)實驗,或?qū)a(chǎn)物置于4℃短期保存哦。

稀釋系數(shù)tips:1)10X的溶液20μL體系中加2μL,2X的溶液20μL體系中加10μL;2)4X溶液與4X溶液等體積混合后為2X預(yù)混液(Premix)。

最后劃重點,每次PCR實驗時不要忘了包括陰性和陽性對照。


附:可使用到的NEST產(chǎn)品


 PCR系列 

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 移液吸頭 

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 微量離心管 

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